藥局在經營的時候，如果沒有績效考核的制度，那麼就很容易落於以銷售專業，來去認定一個人的才能，而這樣的結果，往往會造成管理人才的斷層，或者是沒有管理人才的狀況。
而藥局的考核制度，可以分為一般人員、專業人員以及管理職的考核。
一般人員的績效考核
一般人員的績效考核，著重於一般店員在店務上，以及相關分工的工作，執行力的考核。傳統藥局在一般店員的部分，會著重在藥助的訓練，協助藥師來去進行相關的工作。而這些工作的考核，也都必須得列出相關的項目以及指標，來去進行績效考核的執行。還有一部分，就是一般店務的工作績效，包含在整齊清潔、店務行政、商品進銷存的管理等等。
而在一般店員的績效考核，通常我們會以態度、任務交辦完成度、相關專業等等項目來去進行績效的考核。
專業人員的績效考核
專業人員的績效考核，通常是針對藥師的績效考核。藥師的績效考核通常比較複雜些，如果藥師只是做調劑處方的工作，沒有在做其他商品銷售的話，那麼就會只針對他在調劑處方藥品的管理，以及健保相關作業的部分進行績效考核。如果藥師有在做銷售的工作，那麼也會針對他在個人銷售的績效上，來去進行相關的考核。
另外，也可以針對藥師在培訓上的工作，來去進行考核。有些藥局通路，會賦予藥師對藥局其他人員進行培訓的工作，而這個部分也可以列為考核的項目之一。
因此在藥師的績效考核上，可分為健保作業的績效考核，以及藥品進銷存管理，還有藥局人員培訓這三個部分進行績效考核的管理。
管理職的績效考核
管理職的績效考核，指的就是藥局店主管的績效考核了。藥局在基層主管通常會分為組長、店副主管、店主管等等三到四個階級區分。每個職務，都會根據它的執掌，來去進行績效的評分。
而在店主管的部分，主要是針對營運績效的項目進行評分，包含業績達成率、毛利率、損益淨利等等的數字來去評分。再加上領導統御及工作任務分派執行度等項目，進行綜合評分。而店副主管及組長，則是根據店主管的績效考核項目，在加上所賦予的工作職權，將績效考核項目進行分權的評估。
根據這些原則，藥局可以建立最適當的績效考核標準，進行藥局應該要有的績效考核，來去做人員工作效能的評估。
傳統藥局的經營與轉型 